TMB naviko mutacijų naštos tyrimas
TMB naviko mutacijų naštos tyrimas (angl. Tumor Mutational Burden) vertina somatinių mutacijų skaičių naviko genomo milijoniniame bazių porų regione. Šis rodiklis padeda numatyti atsaką į imunoterapiją, ypač checkpoint inhibitorius, ir yra svarbus personalizuotos onkologijos įrankis.
Funkcija
- Nustato somatinių mutacijų tankį naviko audinyje.
- Prognozuoja atsaką į imuninės kontrolės taško inhibitorius.
Kilmė
- Mutacijos gali kilti dėl DNR reparacijos defektų, kancerogenų poveikio ar replikacijos klaidų.
- Aukštas TMB dažniausiai stebimas melanoma, plaučių, kolorektaliniame vėžyje.
Procedūra
- Atliekamas naviko biopsijos mėginio (FFPE) arba skystosios biopsijos (kraujo) genomo sekoskaita.
- Naudojamas viso egzomo arba tikslinio genų rinkinio (panel) sekoskaitos metodas.
- Bioinformatinė analizė apskaičiuoja mutacijų skaičių, pašalinus gemalines mutacijas.
Pasiruošimas tyrimui
- Specialaus pasiruošimo nereikia - atliekama pagal gydytojo paskyrimą.
- Biopsijos mėginys turi būti pakankamos kokybės ir naviko ląstelių kiekio.
Aukštas TMB
- Aukštas TMB (≥10 mutacijų/Mb) rodo didelį naviko mutacinį nestabilumą.
- Dažniausiai susijęs su DNR reparacijos sistemos defektais (pvz., dMMR, POLE/POLD1 mutacijos).
- Prognozuoja geresnį atsaką į PD-1/PD-L1 inhibitorius (pembrolizumabą, nivolumabą).
- Gali būti paveldėto vėžio sindromo (pvz., Lynch sindromo) žymuo.
Klinikinės indikacijos
- Įtariant naviko atsaką į imunoterapiją (prieš skiriant checkpoint inhibitorius).
- Nustatant DNR reparacijos sistemos defektus (dMMR/MSI-H navikuose).
- Vertinant prognozę pacientams, sergantiems melanoma, nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu, gaubtinės žarnos vėžiu.
Kada kreiptis
- Onkologas-chemoterapeutas arba onkogenetikas gali paskirti tyrimą po išsamaus naviko profiliavimo.
- Tyrimas atliekamas tik esant patvirtintai vėžio diagnozei.