Histonų modifikacijos kraujyje
Histonų modifikacijos - tai epigenetiniai pakitimai, atsirandantys ląstelių branduolyje ir lemiantys, kaip genai yra įjungiami arba išjungiami. Šis tyrimas suteikia galimybę pažvelgti į genetinės informacijos reguliavimą kraujyje, o tai svarbu diagnozuojant vėžį, neurologinius sutrikimus ir kitas ligas.
Pagrindinė funkcija
- Histonai yra baltymai, apie kuriuos vyniojasi DNR. Jų modifikacijos (acetilinimas, metilinimas, fosforilinimas) keičia chromatino struktūrą ir genų raišką.
- Šios modifikacijos veikia kaip epigenetiniai „jungikliai“: vienos - aktyvuoja genus, kitos - juos slopina.
Kilmė ir reikšmė
- Kraujo ląstelėse (limfocituose, monocituose) histonų modifikacijos gali rodyti lėtinį uždegimą, imuninės sistemos aktyvumą ar ankstyvuosius vėžio pakitimus.
- Šių modifikacijų profilis skiriasi priklausomai nuo aplinkos veiksnių, mitybos, streso ir amžiaus, todėl jis yra vertingas biomarkeris.
Procedūra
- Iš paciento paimamas veninis kraujo mėginys (kaip ir įprastiniam kraujo tyrimui).
- Laboratorijoje iš kraujo išskiriamos ląstelės, o vėliau - jų branduoliai. Toliau atliekama chromatino imunoprecipitacija (ChIP) arba masės spektrometrija, siekiant identifikuoti specifines histonų modifikacijas.
- Gauti duomenys lyginami su kontrolinėmis vertėmis, siekiant nustatyti epigenetinius pokyčius.
Pakitimai, siejami su padidėjusia ar sumažėjusia modifikacijų išraiška
- Padidėjęs histonų acetilinimas dažnai siejamas su aktyvia genų raiška - tai gali rodyti vėžinių ląstelių proliferaciją arba lėtinį uždegimą.
- Sumažėjęs metilinimas (pavyzdžiui, H3K4me3) gali būti susijęs su imuninių atsako sutrikimais, o padidėjęs H3K9me3 - su genų slopinimu, būdingu senstančioms ląstelėms.
- Tam tikros modifikacijos (pvz., H3K27me3) yra specifinės vėžio tipams, padeda nustatyti ligos agresyvumą ir parinkti gydymą.
Indikacijos
- Įtarus onkologinę ligą (ypač leukemiją, limfomą) arba stebint jos progresavimą.
- Esant lėtinėms uždegiminėms būklėms (reumatoidinis artritas, uždegiminės žarnyno ligos) - siekiant įvertinti ligos aktyvumą.
- Kaip papildomas diagnostinis metodas neurologinių sutrikimų (pvz., Alzheimerio ligos) atvejais.
Kokie gydytojai skiria?
- Onkologas, hematologas, reumatologas, neurologas arba genetikas.
