5-hidroksicitozinas
5-hidroksicitozinas yra epigenetinis DNR modifikacijos produktas, atsirandantis oksiduojant 5-metilcitoziną. Jo kiekis ląstelėse atspindi aktyvių epigenetinių procesų būklę ir dažnai tiriamas onkologijoje, neurologijoje bei vystymosi biologijoje.
Funkcija
- Epigenetinė DNR žymė, reguliuojanti genų ekspresiją
- Veikia kaip tarpinis produktas DNR demetilinimo procese
Kilmė
- Sintetinamas fermento TET šeimos (TET1/2/3) veikimo metu
- Gausiausias smegenų audiniuose ir embrioninėse kamieninėse ląstelėse
Procedūra
- Atliekama paėmus veninį kraują arba audinio biopsiją
- DNR išskiriama, apdorojama specifiniais fermentais ir atliekama kiekybinė PGR
- Rezultatas pateikiamas kaip 5-hidroksicitozino procentas nuo bendro citozino
Priežastys
- Aktyvus DNR demetilinimas vėžio ląstelėse
- Padidėjusi TET fermentų ekspresija
- Neurodegeneracinės ligos (Alzheimeris, Parkinsono liga)
- Hipoksija arba oksidacinis stresas
Priežastys
- TET fermentų mutacijos arba slopinimas
- Lėtinis uždegimas
- Mažas deguonies kiekis audiniuose
- Senėjimo procesai
Kada tirti
- Įtariant epigenetinius pokyčius sergant vėžiu
- Stebint gydymo epigenetiniais vaistais efektyvumą
- Tiriant neurologinius sutrikimus
- Konsultuojantis su onkologu ar neurologu
| Bendra | Lyginis kiekis (%) nuo visų citozinų DNR: 0,1-0,7 % (priklausomai nuo audinio) |
|---|---|
| Vyrams | 0,05-0,25 % (iš kraujo ląstelių) |
| Moterims | 0,05-0,25 % (iš kraujo ląstelių) |
