PGR polimerazės grandininė reakcija

PGR (polimerazės grandininė reakcija) - tai molekulinės biologijos metodas, leidžiantis milijonus kartų padauginti specifinę DNR ar RNR seką. Šis tyrimas itin jautriai ir tiksliai nustato net mažiausius patogenų, genetinių mutacijų ar ląstelių pakitimų kiekius, todėl yra auksinis standartas infekcinių ligų, paveldimų sutrikimų ir onkologinių ligų diagnostikoje.

Kas yra PGR polimerazės grandininė reakcija?

Funkcija

Specifinės DNR ar RNR sekos amplifikacija (dauginimas) milijonus kartų
Tikslus patogenų (virusų, bakterijų, parazitų) genetinės medžiagos identifikavimas
Genetinių mutacijų, polimorfizmų ir paveldimų ligų nustatymas
Onkologinių žymenų (pvz., BRCA, EGFR) ir minimalios liekamosios ligos aptikimas

Kilmė

Metodas sukurtas 1983 m. Kary Mullis, už kurį 1993 m. gavo Nobelio chemijos premiją
Remiasi termostabilia DNR polimerazės (Taq polimerazės) fermentu
PGR evoliucionavo iki realaus laiko kiekybinės PGR (qPCR) ir skaitmeninės PGR (dPCR)

PGR tyrimo eiga

Procedūra

Mėginio paėmimas: kraujas, seilės, nosiaryklės tepinėlis, audinio biopsija ar kiti biologiniai skysčiai
Genetinės medžiagos (DNR/RNR) išskyrimas iš mėginio
PGR mišinio paruošimas: mėginys, pradmenys (primeriai), nukleotidai, polimerazės fermentas ir buferis
Termociklerio ciklai: denatūracija (94 °C), prijungimas (50-65 °C) ir elongacija (72 °C) - kartojama 25-40 ciklų
Rezultatų analizė: gelio elektroforezė, fluorescencinė detekcija (qPCR) arba sekoskaita

Teigiamas PGR polimerazės grandininė reakcija rezultatas

Infekcinės ligos

SARS-CoV-2 (COVID-19) - nosiaryklės tepinėlio PGR
ŽIV, hepatito B ir C virusai (kraujo PGR)
Laimo ligos sukėlėjas Borrelia burgdorferi
Tuberkuliozės mikobakterijos (Mycobacterium tuberculosis)
Pneumocystis jirovecii, Citomegalovirusas, Epstein-Barr virusas

Genetiniai ir onkologiniai pakitimai

BRCA1/2 mutacijos - paveldimo krūties ir kiaušidžių vėžio rizika
EGFR, KRAS mutacijos - nesmulkiųjų plaučių vėžio prognozė
Filadelfijos chromosoma (BCR-ABL) - lėtinė mieloleukemija
Cistinės fibrozės (CFTR) geno mutacijos

Kiti atvejai

Paveldimos metabolinės ligos (pvz., fenilketonurija)
Tėvystės nustatymas ir teismo genetika
Maisto produktų ir aplinkos mėginių taršos patikra
Organų transplantacijos donorų ir recipientų HLA tipavimas

Indikacijos: kada atliekamas tyrimas?

Infekcinės ligos

Įtariant ūmią virusinę ar bakterinę infekciją (COVID-19, gripas, Laimo liga)
Kai serologiniai tyrimai (antikūnai) yra neinformatyvūs arba per ankstyvi
Imunosupresuotų pacientų (po transplantacijos, onkologinių ligonių) stebėsena

Genetiniai tyrimai

Paveldimų ligų rizikos vertinimas (šeimos anamnezė)
Prenatalinė diagnostika (amniocentezė, choriono gaurelių biopsija)
Onkologinė molekulinė diagnostika (naviko genotipavimas)

Konsultuojantys gydytojai

Infektologas
Genetikas
Onkologas
Gastroenterologas (hepatitų atvejais)
Pulmonologas (tuberkuliozės atvejais)

PGR polimerazės grandininė reakcija rezultatų interpretacija

Bendra	PGR tyrimo rezultatas paprastai pateikiamas kaip kokybinis (teigiamas / neigiamas) arba kiekybinis (Ct reikšmė arba kopijų skaičius). Teigiamas rezultatas rodo, kad tiriamoje medžiagoje yra ieškomas genetinis fragmentas. Neigiamas rezultatas reiškia, kad fragmentas neaptiktas, tačiau ne visada garantuoja ligos nebuvimą, ypač jei tyrimas atliktas per anksti arba mėginys buvo prastos kokybės.
Vyrams	Kiekybinis PGR (qPCR): Ct reikšmė atvirkščiai proporcinga pradiniam genetinės medžiagos kiekiui - mažesnė Ct reikšmė (pvz., <30) rodo didelį patogeno ar mutantinės DNR kiekį. Didelė Ct reikšmė (pvz., >35) gali reikšti mažą kiekį arba nespecifinį amplifikatą.
Moterims	Nėštumo metu PGR dažnai naudojamas nustatyti virusines infekcijas (citomegalovirusą, toksoplazmozę) arba vaisiaus genetinius sutrikimus (amniocentezės mėginiai). Rezultatų interpretacija priklauso nuo konkretaus patogeno ir klinikinio konteksto.

Ką gali reikšti pakitusi šio tyrimo reikšmė?

Žemiau pateiktos ligos, kurioms esant šio tyrimo rezultatas dažnai skiriasi nuo normos. Juostelės ilgis ir procentas rodo, kuriai daliai sergančiųjų pokytis būdingas.

PGR polimerazės grandininė reakcija padidėja

Sergant šioms ligoms tyrimo rezultatas paprastai būna didesnis už normą

Simptomai, dėl kurių dažnai skiriamas šis tyrimas

Nuolatinis kosulys Plaučių uždegimas Naktinis prakaitavimas Nuolatinis nuovargis

Tinklapyje esanti informacija yra bendro pobūdžio ir nėra individuali medicininė konsultacija. Tyrimų atsakymus turi vertinti sveikatos priežiūros specialistas, atsižvelgdamas į kitus tyrimų duomenis bei Jūsų jaučiamus simptomus. Portalas neprisiima atsakomybės už sprendimus, priimtus pagal šią informaciją.

Diskusija

Pasidalinkite savo patirtimi apie šį tyrimą: kada jis buvo skirtas, koks buvo rezultatas, kaip sekėsi. Jūsų istorija gali padėti kitiems.

Komentarų dar nėra. Būkite pirmas!

Vardas *

El. paštas * (nebus skelbiamas viešai)

Komentaras *

Sutinku su diskusijų taisyklėmis ir patvirtinu, kad už savo komentaro turinį atsakau aš pats. *

Diskusijų taisyklės

Bendrosios nuostatos. Šios taisyklės reglamentuoja komentarų skelbimą portale. Skelbdami komentarą patvirtinate, kad su taisyklėmis susipažinote ir su jomis sutinkate. Portalo administracija turi teisę bet kada taisykles atnaujinti — galioja paskelbimo metu skelbiama redakcija.
Platformos statusas. Portalas yra tik techninė platforma, suteikianti galimybę vartotojams skelbti savo nuomones ir patirtis. Portalas komentarų iš anksto netikrina, jų neredaguoja ir nėra jų autorius, todėl už vartotojų paskelbtą turinį neatsako.
Atsakomybė už turinį. Už komentaro turinį visa apimtimi atsako jį paskelbęs asmuo. Skelbdami komentarą patvirtinate, kad jūsų turinys nepažeidžia Lietuvos Respublikos teisės aktų ir trečiųjų asmenų teisių, ir įsipareigojate atlyginti portalui bei tretiesiems asmenims visus dėl jūsų komentaro patirtus nuostolius.
Draudžiamas turinys. Draudžiama skelbti: nuorodas, reklamą ir savireklamą; necenzūrinę leksiką; įžeidinėjimus, patyčias, šmeižtą ir neapykantos kalbą; savo ar trečiųjų asmenų asmens duomenis (telefono numerius, adresus, el. paštą ir pan.); raginimus nesilaikyti gydytojo nurodymų ar atsisakyti gydymo; klaidinančią medicininę informaciją; autorių teises pažeidžiantį ar kitaip neteisėtą turinį. Sistema dalį tokio turinio atmeta automatiškai, likusį šalina moderatoriai.
Ne medicininė konsultacija. Komentarai yra asmeninės vartotojų nuomonės ir patirtys — jie nėra medicininė konsultacija, diagnozė ar gydymo rekomendacija ir negali pakeisti sveikatos priežiūros specialisto vertinimo. Portalas neatsako už sprendimus, priimtus remiantis komentarų turiniu.
Asmens duomenų tvarkymas. Paskelbiant komentarą įrašoma ir saugoma: jūsų nurodytas vardas, el. pašto adresas, IP adresas, įrenginio bei naršyklės informacija ir paskelbimo laikas. Duomenys tvarkomi komentarų skelbimo, moderavimo ir piktnaudžiavimo prevencijos tikslais, viešai neskelbiami (išskyrus jūsų nurodytą vardą) ir teisės aktų nustatyta tvarka gali būti perduoti kompetentingoms institucijoms. Turite teisę susipažinti su savo duomenimis, prašyti juos ištaisyti ar ištrinti — kreipkitės portale nurodytais kontaktais.
Licencija turiniui. Paskelbdami komentarą suteikiate portalui neatlygintiną, neišimtinę, teritorijos atžvilgiu neribotą teisę komentarą skelbti, saugoti, moderuoti ir cituoti portale.
Moderavimas ir skundai. Portalo administracija turi teisę savo nuožiūra ir be atskiro įspėjimo šalinti ar redaguoti bet kurį komentarą, blokuoti pažeidėjų IP adresus ir apriboti galimybę komentuoti. Apie netinkamą komentarą galite pranešti mygtuku „Skųsti" — pranešimai peržiūrimi moderatorių.
Baigiamosios nuostatos. Taisyklėms taikoma Lietuvos Respublikos teisė. Jei kuri nors taisyklių nuostata pripažįstama negaliojančia, kitos nuostatos lieka galioti. Skelbti komentarus gali tik su šiomis taisyklėmis sutikę asmenys — sutikimas patvirtinamas pažymint langelį prie formos.