Metilinimo profilis
Metilinimo profilis - tai epigenetinis tyrimas, įvertinantis DNR metilinimo pokyčius visame genome arba pasirinktuose genuose. Šis tyrimas padeda nustatyti vėžinių ligų riziką, ankstyvą jų diagnostiką bei gydymo efektyvumo stebėjimą.
Funkcija
- DNR metilinimas yra epigenetinis mechanizmas, reguliuojantis genų aktyvumą - jis gali įjungti arba išjungti genus be pirminės DNR sekos pakitimų.
- Metilinimo profilis leidžia nustatyti, kokiuose genuose vyksta nenormalus metilinimas, dažnai susijęs su vėžio ar kitų ligų vystymusi.
Kilmė
- Metilinimo profiliai gali būti paveldėti arba įgyti dėl aplinkos veiksnių (mitybos, streso, rūkymo).
- Tyrimui naudojamas kraujas, audinių biopsija arba naviko ląstelės.
Procedūra
- Paimamas kraujo mėginys arba naviko audinio gabalėlis (biopsija).
- Išskiriama DNR ir atliekama bisulfitinė konversija, kuri paverčia nemetilintą citoziną į uracilą.
- Naudojant sekoskaitos arba mikrogardelių metodus, nustatoma metilintų / nemetilintų CpG salelių proporcija.
- Rezultatai lyginami su normalių audinių metilinimo profiliu - nustatomi statistiškai reikšmingi nukrypimai.
Padidėjusi metilinimo aktyvumas (hipermetilinimas)
- Dažnai nustatomas naviką slopinančiuose genuose - jie yra išjungiami, o tai skatina nekontroliuojamą ląstelių dalijimąsi.
- Gali būti ankstyvas vėžio (pvz., krūties, storosios žarnos, plaučių) požymis.
- Susijęs su genetinėmis ligomis, tokiomis kaip imunodeficitai ar neurologiniai sutrikimai.
Sumažėjusi metilinimo aktyvumas (hipometilinimas)
- Gali aktyvinti onkogenus, todėl ląstelės įgyja augimo pranašumą.
- Stebimas sergant lėtinėmis uždegiminėmis ligomis ir autoimuninėmis patologijomis.
- Kartais susijęs su vaisingumo sutrikimais arba embriono vystymosi defektais.
Kada rekomenduojama
- Įtariant paveldimą vėžio sindromą (pvz., Lynch sindromą) - onkologas gali skirti tyrimą.
- Ankstyva vėžio diagnostika - pavyzdžiui, atrankiniai tyrimai didelės rizikos grupėse.
- Stebint gydymo efektyvumą - po chemoterapijos ar imunoterapijos vertinama, ar metilinimo profilis normalizuojasi.
- Neurologiniai sutrikimai, pvz., Rett sindromo arba autizmo spektro sutrikimų diferencinė diagnostika - genetikas ar neurologas gali rekomenduoti.
Gydytojų specialybės
- Onkologas
- Genetikas
- Neurologas
- Medicinos genetikos konsultantas